专利名称：用于重定向抗体特异性的高亲和力衔接分子的制作方法
用于重定向抗体特异性的高亲和力衔接分子相关申请本申请要求2009年10月5日提交的美国临时申请系列号61/248，778和2009年 11月2日提交的美国临时申请系列号61/257，351的优先权。上述申请的全部内容在此通过引用引入。
背景技术：
重定向免疫系统以攻击新的靶标的概念作为用于靶向免疫治疗的有吸引力的策略长期以来引起科学家的兴趣。通过重定向天然的循环人抗体以攻击疾病区域如癌症、自身免疫性疾病和传染病中的所期望的靶标，人们可以避免特别免疫的需要。虽然这一策略已经显示出成功的早期迹象，但大多数研究没有超出体外验证的水平。例如，如果使用已经存在于一般人群中的抗体，这一策略将是特别有价值的并且可以制备成适于经口施用。因此，本领域需要改进的重定向抗体特异性的方法。
发明内容
本发明提供分离的衔接分子，特别是双特异的衔接肽，其以高结合亲和力和选择性结合抗体和期望的目标分子。由于其高结合亲和力和选择性，本发明的衔接分子能够有效地将循环抗体重定向至通常不被抗体分子结合的目标分子。此外，本文中披露的衔接分子提供了与传统的抗体介导疗法相比的一种或多种下述优点1)使得能够同时募集多个抗体类效应子功能；幻可以使用本发明的方法快速产生；；3)具有低商品成本；和4)当向使用对象施用时不引起IgE-介导的超敏反应。所述衔接分子通常包含与一个或多个配体部分连接的一个或多个靶向部分。在某些实施方式中，所述配体部分包含一个或多个Gal抗原(例如，Gal-a-l-3-Gal)或其模拟物。在一个实施方式中，所述靶向部分包含肽，例如VEGF或TNFa-结合肽。示例性的 VEGF-结合肽具有一个或多个如SEQ ID NO. 1、2、3和/或4所示的氨基酸序列。在另一个优选的实施方式中，所述肽(例如，如SEQ ID NO. 1、2、3和/或4所示的肽序列)与包含一个或多个Gal抗原(例如，Gal-α -l-3-Gal 二糖)的配体部分连接。在其它实施方式中，靶向部分包含一个或多个抗体或其抗原结合片段。合适的抗体包括但不限于阿昔单抗(Abciximab)、阿达木单抗(Adalimumab)、阿仑珠单抗(Alemtuzumab)、巴利昔单抗(Basiliximab)、贝伐单抗(Bevacizumab)、西妥昔单抗 (Cetuximab)、聚乙二醇塞妥珠单抗(Certolizumab pegol)、达利珠单抗(Daclizumab)、依库珠单抗(Eculizumab)、依法利珠单抗(Efalizumab)、吉妥珠单抗(Gemtuzumab)、替伊莫单抗(Ibritumomab tiuxetan)、英夫利昔单抗 Qnfliximab)、莫罗单抗(Muromonab)-CD3、 那他珠单抗(Natalizumab)、奥马珠单抗(Omalizumab)、帕利珠单抗(Palivizumab)JS 尼单抗(Panitumumab)、兰尼单抗(Ranibizumab)、利妥昔单抗(Rituximab)、托西莫单抗 (Tositumomab)、曲妥珠单抗(Trastuzumab)和/或戈利木单抗(Golimumab)，或其抗原结合片段。在优选的实施方式中，抗体(例如，一个或多个上面公开的抗体)或其抗原结合片段与包含一个或多个Gal抗原(例如，Gal-a-l-3-Gal)的配体部分连接。在另一个优选的实施方式中，抗体(例如，一个或多个上面公开的抗体)或其抗原结合片段与包含一个 Gal-a-l-3-Gal 二糖的配体部分连接。在另一个优选的实施方式中，包含一个或多个(^al 抗原(例如，fel-a-l-3-Gal)的配体部分与抗体的一个或多个可变区连接。在其它实施方式中，靶向部分包含抗体样分子。合适的抗体样分子包括但不限于 Adnectins、亲禾口体(Affibodies)、DARPins> Anticalins、Avimers 禾口 Versabodies,或其抗原结合片段。在优选的实施方式中，抗体样分子与包含一个或多个Gal抗原(例如， Gal-a-l-3-Gal)的配体部分连接。在其它实施方式中，本发明的靶向部分包含细胞表面受体或其片段的细胞外部分。合适的细胞表面受体包括但不限于TNF家族受体(例如，TNF α受体，例如，人TNF α 受体)和酪氨酸激酶家族的生长因子受体(例如，P185HER2)。在优选的实施方式中，细胞表面受体分子的细胞外部分与包含一个或多个Gal抗原(例如，Gal-a-l-3-Gal)的配体部分连接。在另一个优选的实施方式中，细胞表面受体分子的细胞外部分与包含一个 Gal-a-l-3-Gal 二糖的配体部分连接。在其它实施方式中，靶向部分包含用于细胞表面受体的配体。在优选的实施方式中，配体与包含一个或多个Gal抗原(例如，Gal-a-l-3-Gal)的配体部分连接。在另一个优选的实施方式中，配体与包含一个feil-a -l-3-Gal 二糖的配体部分连接。另一方面，本发明也提供了用于鉴定分离的衔接分子的方法，这类方法包括提供编码候选靶向部分的群体的随机化文库；从展示文库中选择以高亲和力和/或选择性与目标分子结合的靶向部分；通过连接部分连接靶向部分和配体部分以形成候选衔接分子；以及评价候选衔接分子将循环抗体的特异性重定向至目标分子的能力。用于本发明的方法中的合适的筛选方法包括mRNA展示、核糖体展示、酵母展示、噬菌体展示或合成肽文库的筛选。在一个优选的实施方式中，mRNA展示文库用于选择靶向肽。在另一个优选的实施方式中，噬菌体展示文库用于选择靶向肽。本发明的进一步方面提供了治疗受试者的疾病(例如，癌症、传染病或自身免疫疾病)的方法，包括向受试者施用有效量的本发明的分离的衔接分子，从而治疗所述疾病。 在特定的实施方式中，所述疾病为黄斑变性、糖尿病性视网膜病变、牛皮癣、糖尿病、心血管缺血、牛皮癣、类风湿性关节炎和骨关节炎中的至少一种。
图1为本发明的示例性衔接分子的示意图。所述衔接分子为双特异性肽，包含针对目的靶标的高亲和力肽靶向部分和包含抗gal抗体的糖肽表位的配体部分。通过结合目标分子和天然存在的抗gal抗体，衔接分子能够重定向抗体的效应子功能以作用于目标分子。图2提供了在mRNA展示期间进行的各种个方法步骤的概述。图3描述了可以用于mRNA展示中用于选择高亲和力衔接肽的示例性肽文库。图4描述了本发明的四个示例性高亲和力VEGF靶向肽。图5描述了用于偶联目标部分(例如，本发明的VEGF靶向部分)到配体部分上的示例性方法和接头。
图6描述了目标部分/配体部分偶联反应的HPLC和质谱分析。图7描述了优化的目标部分/配体部分偶联反应的HPLC和质谱分析。图8描述了证明本发明的VEGF-结合衔接体重定向天然存在的抗gal抗体以结合 VEGF的效力的体外分析的结果。
具体实施例方式本说明书特别地描述了以高结合亲和力和选择性结合抗体和目标分子的新的衔接分子的鉴定和制备。如本文中使用的，术语“衔接体”指的是肽促进抗体与该抗体通常不结合的目标分子之间的功能性相互作用的能力。例如，本发明的衔接分子能够结合抗体和目标分子，以使得抗体和靶标彼此紧密接近。在一些实施方式中，所述抗体能够促进对目标分子的抗体反应。示例性的抗体反应可以包括目标分子(例如，可溶性因子，如细胞因子或生长因子)的中和作用或调理作用。可选择地，当目标分子存在于病毒表面上时，所述抗体可以促进病毒的中和作用或调理作用。在其它实施方式中，目标分子可以存在于细胞(例如，感染的细胞或肿瘤细胞)的表面上并且通过衔接肽将抗体募集到细胞上促进抗体介导的效应子反应的诱导(例如，诱导补体级联或抗体依赖性细胞毒性(ADCC))。由于本文中公开的衔接分子不明显活化嗜碱性粒细胞而是特别有利的，且因此在向受试者施用时不引起 IgE超敏反应。本发明的衔接分子包含至少三个部分(a)靶向部分、(b)配体部分和(C)接头部分。靶向部分(a)是以高亲和力和/或选择性结合目标分子的部分。配体部分(b)是循环抗体以高亲和力和/或选择性结合的部分。靶向部分和配体部分通过介于其间的接头部分 (c)可操作地连接。所述接头部分可以是共价键、化学接头或肽氨基酸序列，或能够连接衔接肽的靶向部分和配体部分的任何其它部分。(a)靶向部分针对其与目标分子以高亲和力和/或选择性结合的能力选择对本发明的靶向部分。在特定实施方式中，靶向部分以100纳摩尔或更低(例如，IOnM或更低、InM或更低、 IOOpM或更低、IOpM或更低或IpM或更低)的解离常数(KD)与目标分子特异性结合。在其它实施方式中，靶向分子表现出高选择性。“特异性结合”指的是所述部分识别目标分子并与目标分子相互作用，但是基本不识别和与样品如生物样品中的其它分子相互作用。在特定实施方式中，对于目标分子的靶向部分的结合亲和力比对于非目标分子的结合亲和力高至少1000倍(例如，高IO3倍、IO4倍、IO5倍、IO6倍或IO7倍)。可以针对其以高选择性和/或亲和力结合实际上任何目标分子的能力选择靶向部分。在特定实施方式中，靶向部分结合病原体相关的目标分子，包括但不限于来自病毒 (例如，HAV, HBV或HCV、HIV、流感病毒)、细菌、酵母、寄生虫或真菌的表面蛋白质或抗原。 在其它实施方式中，目标分子为细胞表面蛋白，包括但不限于来自感染的宿主细胞或肿瘤细胞的细胞表面抗原或受体。示例性的肿瘤相关抗原包括酪氨酸激酶家族的生长因子受体，P185HER2。在其它实施方式中，目标分子为激素或生长因子。示例性的激素或生长因子包括肿瘤坏死因子α (TNFa)或血管内皮生长因子(VEGF)。在其它实施方式中，目标分子为抗体(例如，自身抗体)。在一个优选的实施方式中，本发明的靶向部分包含肽部分。肽靶向部分的长度理想地为至少3-200个氨基酸，优选至少3-100个氨基酸，更优选3-50个氨基酸，再更优选 3-30 个氨基酸(例如，3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、 24,25,26,27,28,29或30个氨基酸)。用作靶向部分的示例性的肽在W0/2010014830中描述，其全部内容在此通过引用引入。在优选的实施方式中，肽为包含任一个或多个下述氨基酸序列或由任一个或多个下述氨基酸序列组成的VEGF-结合肽或其VEGF结合部分SEQ ID NO. 1H-Gly-Val-Gln-Glu-Asp-Val-Ser-Ser-Thr-Leu-Gly-Ser-Trp-Val-Leu-Leu-Pro -Phe-His-Arg-Gly-Thr-Arg-Leu-Ser-Val-Trp-Val-ThrSEQ ID NO. 2H-Gly-Gly-Phe-Glu-Gly-Leu-Ser-Gln-Ala-Arg-Lys-Asp-Gln-Leu-Trp-Leu-Phe -Leu-Met-Gln-His-Ile-Arg-Ser-Tyr-Arg-Thr-Ile-ThrSEQ ID NO. 3H-Gly-Val-Gly-Gly-Ser-Arg-Leu-Glu-Ala-Tyr-Lys-Lys-Asp-His-Arg-Val-Phe -Gln-Met-Ala-Trp-Leu-Gln-Tyr-Tyr-Trp-Ser-Thr-Thr ；禾口 / 或SEQ ID NO. 4H-Gly-Ser-Gly-Ser-Gly-Asn-Ala-Leu-His-Trp-Val-Cys-Ala-Ser-Asn-Ile-Cys -Trp-Arg-Thr-Pro-Trp-Ala-Gly-Gln-Leu-Trp-Gly-Leu-Val-Arg-Leu-Thr在其它实施方式中，本发明的靶向部分包含抗体，或其结合片段(例如，CDR(例如，CDRH3)、可变域(VH或VL)或Fab片段)。来自任何动物物种的任何抗体或其片段预期用于本文中描述的方法和组合物中。合适的抗体和抗体片段包括但不限于单链抗体(参见，例如，Bird 等(1988)kience 242 :423-426 ；和 Huston 等(1988)Proc. Natl. Acad. ki. U. S. A 85 :5879-5883,其各全部内容在此引入作为参考)、域抗体(参见，例如，美国专利 6，291，158 ；6，582,915 ；6，593,081 ；6，172，197 ；6，696，245，其各全部内容在此引入作为参考)、纳米抗体(Nanobodies)(参见，例如，U. S. 6，765，087，其全部内容在此引入作为参考) 和UniBodies (参见，例如，W02007/059782，其全部内容在此引入作为参考)。在一些实施方式中，抗体为阿昔单抗、阿达木单抗、阿仑珠单抗、巴利昔单抗、贝伐单抗、西妥昔单抗、聚乙二醇塞妥珠单抗、达利珠单抗、依库珠单抗、依法利珠单抗、吉妥珠单抗、替伊莫单抗、英夫利昔单抗、莫罗单抗-CD3、那他珠单抗、奥马珠单抗、帕利珠单抗、帕尼单抗、兰尼单抗、利妥昔单抗、托西莫单抗、曲妥珠单抗和/或戈利木单抗或其抗原结合片段。在其它实施方式中，本发明的靶向部分包含抗体样分子。合适的抗体样分子包括但不限于Adnectins (参见，例如，WO 2009/083804，其全部内容在此引入作为参考)、亲和体(参见，例如，美国专利号5，831，012，其全部内容在此引入作为参考)、DARPins(参见，例如，美国专利申请公开号2004/01320 ，其全部内容在此引入作为参考)、Anticalins (参见，例如，美国专利号7，250，四7，其全部内容在此引入作为参考)、AvimerS (参见，例如，美国专利申请公开号20061(^86603，其全部内容在此引入作为参考)和Versabodies (参见， 例如，美国专利申请公开号2007/0191272，其全部内容在此引入作为参考)。在其它实施方式中，本发明的靶向部分包含用于细胞表面受体的配体，其中，所述配体能够将衔接分子募集到表达所述细胞表面受体的细胞。在其它实施方式中，本发明的靶向部分包含细胞表面受体或其片段的胞外部分，其中，所述细胞表面受体或其片段能将衔接分子募集到所述细胞表面受体的同源配体。合适的细胞表面受体包括但不限于TNF家族受体(例如，TNF α受体，例如，人TNF α受体)和酪氨酸激酶家族的生长因子受体(例如，P185HER2)。在一些示例性实施方式中，本发明的靶向部分包含Fc融合蛋白或免疫粘附素 (immunoadhesin)(例如，TNF受体-Fc融合体，如依那西普(Etanerac印t))。(b)配体部分本发明的配体部分包含通过受试者中存在的免疫粘附素(Fe融合蛋白)结合的抗原域。在一些实施方式中，配体部分被循环抗体结合。循环抗体可由于天然获得性免疫力而在受试者中存在。可选择地，循环抗体作为受试者的在先免疫的结果而存在。例如，循环抗体可作为童年期对天花、麻疹、风疹、疱疹、肝炎和脊髓灰质炎疫苗接种的结果而存在。因此，配体部分可包含被这些循环抗体识别的一个或多个表位。然而，一些实施方式中，配体部分与已经施用于受试者的抗体相互作用。例如，与本发明的衔接分子的配体部分相互作用的抗体可以与衔接分子共施用。另外，与配体部分相互作用的抗体可能通常在受试者中不存在，但是所述受试者通过引入生物材料或抗原 (例如，血清、血液或组织)从而在受试者中产生高滴度的抗体而已经获得该抗体。例如，经历输血的受试者获得多种抗体，其中一些抗体可与衔接肽的配体部分相互作用。配体部分可包含任何能结合抗体的化合物，包括但不限于肽、碳水化合物、脂质、 抗体或抗体样分子。在一些实施方式中，配体部分(例如，肽、抗体或抗体样分子)可包含一个或多个非天然氨基酸。优选地，配体部分包含结合“高滴度抗体”的表位。本文中使用的术语“高滴度表位”指的是对于抗原(例如，抗原域上的表位)具有高亲和力的抗体。 例如，在固相酶联免疫吸附分析(ELISA)中，高滴度抗体对应于血清样品中存在的抗体，所述抗体在将血清在适当的稀释缓冲液中稀释到约1 100-1 1000的范围后在该分析中保持阳性。其它的稀释范围包括1 200-1 IOOOU 200-1 900,1 300-1 900、 1 300-1 800、1 400-1 800、1 400-1 700、1 400-1 600 等。在某些实施方式中，血清和稀释缓冲液之间的比例为大约1 IOOU 150,1 200,1 250,1 300、 1 350、1 400、1 450、1 500、1 550、1 600、1 650、1 700、1 750、1 800、 1 850,1 900,1 950,1 1000。在某些实施方式中，配体部分为从抗体的已知目标分子(例如，来自病原体、肿瘤细胞或感染的宿主细胞的表面蛋白)获得的抗原肽。肽配体部分的长度理想地在至少3-200个氨基酸之间，优选3-100个氨基酸之间，更优选3-50个氨基酸之间，再更优选 10-25 个氨基酸之间(例如，3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、 23、24、25、26、27、28、四或30个氨基酸)。在一些实施方式中，肽由天然氨基酸组成。在其它实施方式中，肽包括一个或多个非天然氨基酸(例如，D-氨基酸)。在某些实施方式中，配体部分为糖基化配体部分。糖基化配体部分可包含由受试者中的抗体识别的抗原性糖或聚糖部分，或由受试者中的抗体识别的抗原性糖或聚糖部分组成。在一些实施方式中，糖基化配体部分与衔接分子的靶向部分直接或间接(即，通过接头部分)连接。这种配体部分缺少抗原性肽部分。在其它实施方式中，糖基化配体部分为包含额外抗原性肽元件(例如，包含病原体的肽或表位的抗原域)的糖肽。示例性的糖基化配体部分源自血型抗原。这些抗原通常为位于红细胞细胞膜外侧
8的表面标志物。这些表面标志物大多数为蛋白质，然而，一些是与脂质或蛋白质结合的碳水化合物。结构上，可以用于本文中描述的实施方式的血型决定簇分为两个基本类别，称为I 型和II型。I型包含由与N-乙酰葡糖胺连接的半乳糖1-3 β组成的主链，而II型包含在相同的构件块之间的1_4β连接。这些主链结构的岩藻糖基化位置和程度产生路易斯型 (Lewis-type)和H-型特异性。例如，仅在主链中的半乳糖部分中的C2-羟基处存在a_单岩藻糖基支链构成H-型特异性(I和II型)，而通过a-连接的半乳糖或a_连接的N-乙酰半乳糖胺的取代的进一步排列提供了为人熟知的血清学血型分类A、B和0的分子基础。 通过首先确定患者特定血型抗原集，人们可以选择包含患者全部类型以外的一个或多个血型抗原的配体部分，以产生对包含这个配体部分的衔接分子的强效反应且因而将患者中存在的抗体重定向至由所述衔接分子的靶向部分结合的目标分子。示例性的血型抗原在美国专利号7，318，926的表2中详细描述，其全部内容在此通过引用引入。在某些优选的实施方式中，糖基化配体部分包含gal抗原的一个或多个 gal-a-l-3gal 二糖糖单元。gal抗原通过糖基化酶半乳糖基转移酶(α (1,3)GT)在猪、小鼠和新世界猴的细胞表面上大量产生。由于人和旧世界灵长类缺乏gal抗原，他们对gal抗原没有免疫耐受且在整个生命过程中响应于胃肠道细菌的抗原刺激产生抗gal抗原抗体 (抗(^1)。已经估计抗gal抗体代表人体中超过2%的循环IgG和1-8%的循环IgM。抗 Gal与供体器官的内皮细胞表面的糖脂和糖蛋白上表达的gal抗原的结合导致补体级联的活化和超急性排斥，并且在补体依赖的迟发性异种移植物排斥的发生中起重要作用。因此， gal抗原具有产生强效免疫反应的能力。在某些优选的实施方式中，待结合或并入衔接分子中的糖基化配体部分基本上由一个或多个fell-α (1-3)-Gal 二糖糖单元组成，并且缺少Gal抗原的任何剩余部分(例如，GlcNac或Glc)。例如，一个或多个fell-α (1_3)-Gal 二糖可以通过在二糖单元的还原端的游离羟基(例如，不参与糖苷键的Cl碳的羟基)连接衔接分子的靶向部分。在某些实施方式中，Gal 二糖在游离羟基处通过间隔体部分(例如，C1-C6烷基间隔体)与靶向部分连接。不限于任何特定理论，据认为Gal抗原的(ial-α (1_3)-Gal 二糖部分优先与抗-Gal抗体连接，但是对凝集素(例如，半乳糖凝集素-3(Galectin-3))或与Gal抗原的其它部分(例如，Gal-β (l-4)-GlcNAc部分)结合的其它分子显示出有限的结合。 在其它实施方式中，待结合或并入衔接分子的糖基化配体部分包含Gal抗原的额外糖残基。例如，可以并入gal抗原的一个或多个三糖(Gal-α (1-3)-Gal-β (1_4)-GlcNAc或 Gal-α (1-3)-Gal-β (1—4)-Glc)、四糖(Gal-α (1-3)-Gal-β (1-4)-GlcNAc-β (1-3)-Gal) 或五糖(Gal-α (1-3)-Gal-β (1-4)-GlcNAc-β (1-3)-Gal-β (1-4)-Glc)单元。在某些实施方式中，待结合或并入到衔接分子的gal抗原选自gal-d-d， 3) gal系列的新糖蛋白并可包括fell α l-3Gal_BSA (3-原子间隔体)、Gal α l-3Gal_BSA(14-原子间隔体)、Gal α l-3Gal_HSA(3-原子间隔体)、Gal α l-3Gal-HSA(14-原子间隔体)、Gal α l_3Gal β l-4GlcNAc_BSA (3_ 原子间隔体)、 Gal α l-3Gal β l-4GlcNAc_BSA(14-原子间隔体)、Gal α l_3Gal β l-4GlcNAc_HSA(3_ 原子间隔体)、Gal α l-3Gal β l-4GlcNAc_HSA(14-原子间隔体)、Gal α l_3Gal_五糖_BSA(3_原子间隔体)等。在其它实施方式中，gal抗原可以选自gal α (1，3) gal类似物新糖蛋白，包括 fell α l-3Gal β l_4Glc_BSA (3-原子间隔体)、Gal α l_3Gal β l-4Glc_HSA (3-原子间隔体)、Galal-3Gal β l-3GlcNAc_BSA(3-原子间隔体)、Gal α l_3Gal β l-3GlcNAc_HSA(3-原子间隔体)、Gal α l-3Gal3 1-4(3-脱氧 GlcNAc)-HSA (3-原子间隔体)、Gal α l-3Gal β 1-4 (6-脱氧 GlcNAc)-HAS 等。在再其它实施方式中，Gal抗原的肽模拟物可以并入本发明的衔接分子中。示例性的肽模拟物包括α Gal-连接的糖肽fell- α -YffRY, Gal-α -TffRY和fell- α -RWRY。其它肽模拟物可使用Xian等(参见J. Comb. Chem.，6 :126-134 (2004)，此处引入作为参考)的方法通过筛选α Gal糖肽的随机化文库的抗-Gal抗体结合活性来进行鉴定。Gal抗原，或其肽模拟物，可以使用任何本领域公认的方式与靶向部分(共价和/ 或非共价地)连接。本领域公认的非共价连接包括生物素-亲和素或生物素-抗生蛋白链菌素连接和其它高亲和力结合伴体(例如，亮氨酸拉链等)。共价连接的合适方式包括但不限于图4中和在此处通过引用全部引入的美国专利申请号20100183635中所述的那些。 例如，gal抗原(或肽模拟物)可以通过合成化学接头与多肽靶向部分的多肽骨架直接连接。示例性的合成化学接头包括双功能接头部分，例如具有马来酰亚胺官能性的接头。例如，双功能接头部分可以通过靶向部分中的氨基和配体部分中的硫醇部分连接靶向部分和配体部分，反之亦然。在一个示例性实施方式中，马来酰亚胺接头(例如，硫代-SMCC)用于将多肽靶向部分的半胱氨酸残基连接到氨基修饰的Gal抗原(例如，图5的Ii-(CH2) 3-NH2) 的氨基上。额外地或可选择地，gal抗原可与糖蛋白靶向部分的N-连接的寡糖连接。在一些实施方式中，一个或多个Gal抗原(例如，gal-a-(l，3)gal)或其肽模拟物连接到目标部分上的单一位点。在其它实施方式中，一个或多个Gal抗原(例如，gal-a-(l，3)gal)或其肽模拟物连接到目标部分上的多个位点。在某些实施方式中，对接头部分进行化学修饰以降低酶促降解或化学降解。如本文中披露的包含Gal抗原的衔接分子是特别有利的，因为其不明显活化嗜碱性粒细胞，且因此在向受试者施用时不引起IgE介导的超敏反应。尽管如此，在一些实施方式中，对本发明的衔接分子活化嗜碱性粒细胞的能力进行测定。用于测定嗜碱性粒细胞活化的合适分析方法是本领域已知的(参见，例如，J. Allergy Clin Immunol (2002) 110102-9，此处全部引入作为参考)。在某些实施方式中，配体部分包含聚合的结合分子，其中单体不是氨基酸。在某些示例性实施方式中，高亲和力衔接分子选自由下组(a)H-Gly-D-Val-D-Gln-D-Glu-D-Asp-D-Val-D-Ser-D-Ser-D-Thr-D-Leu-Gly-D-Ser-D-Trp-D-Val-D-Leu-D-Leu-D-Pro-D-Phe-D-His-D-Arg-Gly-D-Thr-D-Arg-D-Leu-D-S er-D-Val-D-Trp-D-Val-D-Thr-PEG2-Cys-X-Y ；(b)H-Gly-Gly-D-Phe-D-Glu-Gly-D-Leu-D-Ser-D-Gln-D-Ala-D-Arg-D-Lys-D-As p-D-Gln-D-Leu-D-Trp-D-Leu-D-Phe-D-Leu-D-Met-D-Gln-D-His-D-IIe-D-Arg-D-Ser-D-T yr-D-Arg-D-Thr-D-I Ie-D-Thr-PEG2-Cys-X-Y ；(c)H-Gly-D-Val-Gly-Gly-D-Ser-D-Arg-D-Leu-D-Glu-D-Ala-D-Tyr-D-Lys-D-Ly s-D-Asp-D-His-D-Arg-D-Val-D-Phe-D-Gln-D-Met-D-Ala-D-Trp-D-Leu-D-Gln-D-Tyr-D-T yr-D-Trp-D-Ser-D-Thr-D-Thr-PEG2-Cys-X-Y ；和(d)H-Gly-D-Ser-Gly-D-Ser-Gly-D-Asn-D-Ala-D-Leu-D-His-D-Trp-D-Val-D-Cy s-D-Ala-D-Ser-D-Asn-D-Ile-D-Cys-D-Trp-D-Arg-D-Thr-D-Pro-D-Trp-D-Ala-Gly-D-Gln-D-Leu-D-Trp-Gly-D-Leu-D-Val-D-Arg-D-Leu-D-Thr-PEG2-Cys-X-Y ；其中，X为具有马来酰亚胺官能性的双功能化学接头；以及Y为氨基修饰的 Gal-l-3-Gal 二糖。(c)修饰的衔接分子可以对本发明的衔接分子的一个或多个部分进行修饰。在某些实施方式中，对衔接分子的肽部分进行修饰。例如，衔接分子的肽部分可以进行修饰以包括非天然氨基酸，如在此处引入作为参考的美国专利号6，559，126中描述的那些。例如本发明的肽可以由一个或多个，或最优选地所有，为D-型光学异构体的氨基酸组成。这些D-肽相对于抗体和其它蛋白质治疗剂有几种好处。D-肽的较小尺寸和较高稳定性使其更容易配制成用于经肺、局部和经口递送。D-肽也已知为弱免疫原(Dintzis等，(1993)PROTEINS Structure, Function, and Genetics 16, 306-308) 0此外，与其它肽类药物相比，D-肽对酶降解的抗性以及其与聚合物结合的能力导致了增强的药代动力学。而且，D-肽具有降低的生长成本， 这一优势可以传导到消费者。也可以通过多种标准化学方法对衔接分子的肽成分进行修饰(例如，可以用保护基对氨基酸进行修饰；可以将羧基末端氨基酸形成为末端酰胺基团；可以用基团修饰氨基末端残基以，例如增强亲脂性；或可以将多肽化学糖基化或以其它方式进行修饰以增加稳定性或体内半衰期)。可以将本发明的衔接分子设计为包括促进溶解性的化学修饰或特定的氨基酸序列。例如，在一些实施方式中，可以将肽部分合成为在N-末端或C-末端区域包括氨基酸DDD或KKK。额外地或可选择地，可以将肽或其它靶向部分合成为例如在N-末端和/或C-末端区域包括PEG化部分。示例性PEG化部分包括PEG2-NH2和PEG2-Cys-NH2部分。本发明也包含本文中描述的序列的“保守序列修饰”或“保守氨基酸修饰”，即不显著影响或改变由核苷酸序列编码的或包含该氨基酸序列的肽的结合性质的氨基酸序列修饰。这种保守序列修饰包括核苷酸和氨基酸置换、添加和缺失。也可以通过本领域已知的标准技术，如定点诱变和PCR-介导的诱变将修饰引入到序列中。在一些实施方式中，通过合理设计选择修饰，并且通过如本文中描述的化学合成产生设计的肽。“保守氨基酸修饰” 包括作为其中氨基酸残基被具有相似侧链(例如，相似的尺寸、形状、电荷、化学性质包括形成共价键或氢键的能力等)的氨基酸残基替代的置换的保守氨基酸置换。本领域已经定义了具有相似侧链的氨基酸残基的家族。这些家族包括具有碱性侧链(例如，赖氨酸、精氨酸、组氨酸)、酸性侧链(例如，天冬氨酸、谷氨酸)、不带电的极性侧链(例如，甘氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸、半胱氨酸、色氨酸)、非极性侧链(例如，丙氨酸、 缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、甲硫氨酸)、β-分支侧链(例如，苏氨酸、缬氨酸、异亮氨酸)和芳香侧链(例如，酪氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、组氨酸)的氨基酸。本发明的肽或其模拟物可以通过一个或多个置换进行修饰，特别是在预期不与目标蛋白相互作用的蛋白质部分中。预期肽中多至5^^10%,20^^30%,40^^50%或甚至 50%以上的氨基酸可以通过保守置换改变而基本上不改变蛋白质对目标蛋白的亲和力。可能的是这种变化改变多肽的体内免疫原性，且在免疫原性降低的情况中，这种变化是希望的。可以在本发明的肽分子结构中进行的类似置换的另外的非限制性实例包括用D-酪氨酸、D-吡啶基丙氨酸或D-高苯丙氨酸置换D-苯丙氨酸、用D-缬氨酸或其它具有脂族侧链
11的天然或非天然氨基酸置换D-亮氨酸和/或用D-亮氨酸或其它具有脂族侧链的天然或非天然氨基酸置换D-缬氨酸。在一些实施方式中，保守氨基酸置换单独，即没有氨基酸缺失或添加，是氨基酸修饰的优选类型。本领域技术人员将理解这种修饰或置换可以在DNA水平进行，因此编码改变的或取代的肽，或他们可以在蛋白质水平进行，例如通过直接化学合成。在一些实施方式中，可以将衔接分子的肽或肽部分制成环状。这种“环肽”具有连接两个氨基酸的分子内连接。环肽常常对蛋白水解降解具有抗性，且因此是用于经口施用的良好候选物。分子内连接可以包含中间连接基团或可以涉及氨基酸残基之间的直接共价键合。在一些实施方式中，N-末端和C-末端氨基酸连接。在其它实施方式中，一个或多个内部氨基酸参与环化。其它本领域已知的方法可用于环化本发明的肽。例如，可以通过侧链叠氮-炔1，3-偶极环化加成反应形成环肽(Cantel等，J. Org. Chem.，73 (15)， 5663-5674，2008，此处引入作为参考)。例如，也可以通过此处引入作为参考的美国专利号 5596078 ；4033940 ；4216141 ；4271068 ；5726287 ；5922680 ；5990273 ；6242565 ；以及 Scott 等，PNAS. 1999. vol. 96 no. 24第13638-13643页公开的方法实现肽的环化。在一些实施方式中，分子内连接可以是二硫键模拟或保持另外通过二硫键产生的结构的二硫键模拟物。在一些特别优选的实施方式中，肽的环化通过分子内二硫键发生。在一些优选的实施方式中，分子内二硫键的形成增加了肽的亲和力。因此，可以在选择之前或选择期间在允许二硫键形成的条件下(例如，氧化条件)进行用于选择和/或亲和熟化本发明的肽或其模拟物的方法。在一些特别优选的实施方式中，二硫键可以在天然存在于文库或肽中的半胱氨酸残基之间形成，或在一轮或多轮选择过程中通过突变方法将二硫键引入。在其它实施方式中，可以将肽设计为在特定位置包含半胱氨酸残基，以使得可以知道哪个残基参与二硫键。可以通过本领域已知的方法(例如，美国专利号4572798 ；6083715 ；6027888，和 WIPO公开W0/2002/103024，此处引入作为参考)诱导半胱氨酸残基之间的分子内二硫键键
口 O在一些实施方式中，二硫键的形成(或通常环化的或分子内连接的结构的形成) 赋予肽对目标结合重要的特定结构。因此，优选二硫键和/或环化在肽选择之前形成，以使得可以选择由键形成产生的潜在有利的结构。在一些实施方式中，本发明的肽或其模拟物可以具有多于一个、两个、三个或更多的二硫键。可以使用本领域已知的产生和选择具有分子内二硫键、分子内二硫键替代物或其它分子内连接的肽的其它方法。例如，此处引入作为参考的W003040168中描述的方法描述了产生和选择肽适体、conotides和其它环化肽的方法，在一些实施方式中，这些适体、conotides和其它环化肽可以用于本发明的方法中。在相关的实施方式中，可以通过化学交联或其它肽稳定的方法保持或模仿对结合有益的肽构象或结构(例如，增加结合亲和力)。例如，可以通过化学处理或反应稳定由二硫键形成的有益的肽构象或结构，从而使得在没有二硫键的情况下保持所述结构。确实，无论二硫键是否原始存在，都可以采用肽稳定技术稳定本发明的肽。例如，此处引入作为参考的 Jackson 等，J.Am. Chem. Soc. 1991，113，9391-9392 ；Phelan 等，J.Am. Chem. Soc. 1997， 119,455-460 ；Bracken 等，J. Am. Chem. Soc. 1994，116，6431-6432 中描述的技术可以用于稳定本发明的肽或肽部分。可以使用其它稳定肽和肽结构的方法，例如，通过邻烯丙基丝氨酸残基的螺旋的烯属交联(Blackwel 1，H. E. ；Grubbs，R. H. Angew. Chem.，Int. Ed. 1998，37，3281_3沘4，此处引入作为参考)、所有烃交联(Schafmeister 和 Verdine J. Am. Chem. Soc. 2000，122(24)， 5891-5892，此处引入作为参考)和美国专利号7183059 (此处引入作为参考)中公开的方法。Blackwell等和khafmeister等中公开的方法可以被描述为产生“装订(stapled)，， 肽，即共价锁定在特定构象状态或二级结构中的肽，或具有将肽具有形成特定构象或结构的倾向的特定分子内共价连接的肽。如果如此处理的肽倾向于例如，形成对目标结合重要的α-螺旋，那么用于结合的能量阈值将降低。这种“装订”肽已经显示对蛋白酶具有抗性， 并且也可以被设计为更有效地跨过细胞膜(也参见Walensky等，Science2004 =Vol. 305. no. 5689，第 1466-1470 页；Bernal 等，J Am Chem Soc. 2007,129(9) :2456_7，此处引入作为参考)。因此，本发明的肽或肽部分可以被装订或以其它方式修饰以将它们锁定在特定构象形状中或者它们可以被修饰为倾向于有利于结合的特定构象或二级结构。预计这种肽修饰可以在肽选择之前发生，以使得也可以对任何构象限制的利益进行选择。可选择地，在一些实施方式中，可以在选择之后进行修饰以保留已知有益于结合的构象或进一步增强肽候选物。在其它实施方式中，可以对衔接分子的配体部分进行修饰。可以进行所述修饰，例如以通过干扰分子最小化竞争结合或降低配体部分的酶促降解或化学降解(例如，在生理条件下)。如文中使用的，术语“干扰分子”指的是与循环抗体竞争结合衔接分子并(例如， 通过从循环中快速清除衔接分子)阻止发挥其预期的治疗效应的结合分子(例如，循环或细胞表面受体)。例如，糖基化配体可以包含已经被化学修饰以通过抗-Gal抗体增强优先的结合而同时通过凝集素(例如，半乳糖凝集素-3)或其它干扰分子最小化不期望的结合的gal抗原或模拟物。额外地或可选择地，糖基化配体部分可包含已经被化学修饰，例如以降低酶促降解或化学降解或促进共价连接的gal抗原或模拟物。示例性的修饰包括例如， 通过脱水偶联、还原胺化或例如用半乳糖氧化酶的酶促氧化，在gal抗原的糖残基上的反应性羟基上添加生物学惰性保护基团。可以将保护性基团加入到Gal表位的末端Gal残基的 C-6，0H 上(参见，例如 Andreana 等，Glycoconjugate J. ,20 107-118 (2004)) 示例性的保护基团包括胺(例如，氨基吡啶)和肟取代基(例如，O-Me-肟、O-Et-肟、Ο-tBu-肟、 O-Bn-肟和0-烯丙基-肟)。可选择地，极性C-6’ OH基团可以被非极性氢替代以形成6-脱氧-α -Gal 衍生物(参见 Janczuk 等，Carbohydrate Research, 337 1247-1259 (2002)，此处弓丨入作为参考)。在某些示例性实施方式中，Gal表位可以用氨基修饰物(例如，烷基-NH2 取代基)进行修饰(例如，在C-10H)以促进与靶向部分的连接。然后可以使用本领域公认的方法(例如，ELISA)评价抗-Gal抗体与修饰的gal抗原的结合。(d)多价衔接分子预期可以将文中公开的种类的多种肽或肽部分连接以产生具有增加的亲合力或结合价的复合衔接分子。同样，衔接分子的肽或肽部分可以与多种其它多肽连接，例如荧光多肽、靶向多肽和具有明显不同治疗效果的多肽。II.用于鉴定高亲和力衔接分子的方法在某些方面，本发明提供了用于鉴定具有高结合亲和力或选择性的衔接分子的方法。本发明的方法包含(i)至少一个选择步骤以鉴定高亲和力靶向部分(例如，靶向肽部分和/或配体肽部分)，和(ii)连接步骤，其中衔接分子的靶向部分和配体部分连接以形成衔接分子。在某些实施方式中，本发明的方法利用核糖体展示或mRNA展示作为选择步骤以鉴定衔接分子的一个或多个靶向部分。核糖体展示和mRNA展示方法的一般综述由此处全部引入作为参考的 Lipovsek 和 Pluckthun(J. Immunological Methods, 290 :51-67(2004)) 提供。在优选的实施方式中，使用mRNA展示鉴定衔接分子的靶向部分(例如，肽靶向部分)。 示例性mRNA展示方法在图2中描述。简要地，通过例如直接DNA合成或通过体外或体内诱变获得起始文库。然后将双链DNA文库体外转录(例如，使用T7聚合酶)并连接到嘌呤霉素样接头上。进行体外翻译，其中嘌呤霉素样接头与新生的翻译产物反应。在纯化后，得到高度多样化( IO13)的肽-RNA融合分子文库。反转录产生与转录的肽共价连接的cDNA/ RNA杂交体。然后通过使用目标分子(在靶向肽部分的情况下)或抗体(在配体肽部分的情况下)对这个复合物进行选择。对结合目标或抗体分子的肽(例如，在严格洗涤条件下) 进行选择，以及方便地将cDNA洗脱以鉴定选择的肽。所述选择可以进行多次以鉴定高亲和力的结合物。应当注意，在选择过程中，可以在使得在肽中存在分子内二硫键的条件下进行所述选择方法。在其它实施方式中，如果需要，可以阻止二硫键的形成。在额外的或替代的实施方式中，本发明的方法利用噬菌体展示和/或酵母展示技术作为选择步骤以鉴定衔接分子的一个或多个靶向(例如，肽)部分。这种文库筛选方法的非限制性实例在例如，各在此处全文引入作为参考的美国专利号7，195，880 ；6, 951，725 ； 7，078，197 ；7，022，479 ；5，922，545 ；5，830，721 ；5，605，793 ；5，830，650 ；6，194，550 ； 6，699，658 中描述。在其它实施方式中，本发明的方法利用合成肽文库。这类合成肽可以化学合成或酶学产生(例如，通过RNA的体外翻译或通过预先存在的蛋白质的酶促消化)。在一些实施方式中，合成肽文库在固相基质(例如，载玻片)上排列。在某些实施方式中，本发明的方法利用编码与已知与特定目标或抗体分子相互作用的较大多肽的部分对应的随机化肽的mRNA文库(例如，mRNA展示文库)。示例性mRNA 展示文库在图3中描述。例如，肽文库可以包含线性肽分子的群体，其中肽的氨基酸序列在分子内的一个或多个氨基酸位置(优选至少10个或更多个氨基酸位置)是随机化的。这种肽序列的随机化部分的侧翼可以为来自母体多肽的一个或多个恒定区域。在某些实施方式中，本发明的方法包括提供编码候选靶向部分(例如，或肽或多肽)的随机化群体的mRNA展示文库。以举例的形式，靶向肽可以为源自可溶性配体，例如 VEGF,的随机化肽。可以通过从文库中筛选肽-RNA-cDNA融合体选择高亲合力靶向肽。优选进行多个选择循环以富集结合目标分子(例如，VEGF受体)的分子群体。通过降低各个选择步骤中目标分子的浓度，可以在群体中进一步富集以最高亲合力结合目标分子的肽。各个选择步骤中可以利用的额外的选择过程包括(1)反选择以消除非特异性肽；( 竞争洗脱以鉴定点特异性肽；C3)以及在特定溶液条件(例如，高严格洗涤条件)下选择以鉴定稳定肽。在某些实施方式中，在选择之前对文库成员进行修饰以包括能与接头(例如，双功能接头)反应以形成连接部分的偶联部分。在其它实施方式中，在选择步骤后用偶联部分修饰文库成员以促进与连接部分的连接。示例性的偶联部分包括能与马来酰亚胺官能性的双功能接头反应的末端氨基酸(例如，C-或N-末端半胱氨酸或半胱氨酸类似物)或氨基酸侧链(例如，半胱氨酸或半胱氨酸类似物侧链)。一旦已经鉴定了高亲合力靶向部分，肽就可以通过连接部分与预选择的配体部分连接，从而产生转接分子。在某些实施方式中，已经使用mRNA展示方法对配体部分进行预选择。可选择地，可以将靶向部分作为恒定区域插入编码候选配体的随机化群体的第二 mRNA展示文库中。然后可以对这个第二mRNA展示文库进行进一步选择步骤，其中相对抗体对文库成员进行筛选以鉴定衔接分子。因此，候选配体优选对应于抗体配体的部分(例如， 表位)。在一个实施方式中，抗体配体部分可以为抗体结合的抗原表位。在另一个实施方式中，抗体配体部分可以为第二抗独特型抗体所结合的第一抗体的独特位(idiotope)。在又另一个实施方式中，抗体配体部分可以为Fc结合蛋白(例如，Fc受体)的Fc结合部分。选择了以高亲合力和/或选择性结合目标分子和抗体分子的衔接分子后，可以评价衔接分子重定向抗体特异性至目标分子的能力。例如，其中目标分子为细胞表面分子， 可以使用本领域公认的技术评价衔接分子诱导效应子功能(例如，抗体依赖性细胞毒性 (ADCC)或补体依赖性细胞毒性(CDC))和细胞杀伤的能力。在再其它实施方式中，文库成员在选择步骤之前与配体部分连接。例如，待筛选的文库的各成员可以用Gal抗原衍生化，然后进行筛选步骤以鉴定高亲和力衔接分子。所述 Gal抗原可以与各肽的末端氨基酸或氨基酸侧链连接。在再其它实施方式中，可以利用反复选择方法，其中在第一选择步骤中(或第一系列的选择步骤中)选择靶向部分，以及将靶向部分的序列并入到mRNA-肽融合体的恒定区域中，以利于第二选择步骤(或第二系列的选择步骤)中配体部分的选择。例如，在连续轮的选择中交替进行第一和第二选择步骤(或系列选择步骤)以鉴定高亲和力衔接分子。III.用于合成高亲和力衔接分子的方法一旦使用本文中描述的方法鉴定了高亲和力衔接分子的成分，它们就可以使用本领域已知的标准方法制备。例如，可以通过重组DNA方法，将编码多肽的核酸序列(例如，cDNA)插入重组表达载体中并在促进表达的条件下表达所述DNA序列制备所述肽。用于核酸操作的一般技术在例如，此处引入作为参考的Sambrook等，Molecular Cloning A Laboratory Manual, Vols. 1-3, Cold Spring Harbor Laboratory Press,2ed. ,1989, 或 F. Ausubel 等，Current Protocols in Molecular Biology (Green Publishing and Wiley-Interscience =New York, 1987)和定期更新中有描述。用于细菌、真菌、酵母和哺乳动物细胞宿主的合适的克隆和表达载体可以Cloning Vectors =A Laboratory Manual, (Elsevier, New York, 1985)中找到，其相关公开内容在此处引入作为参考。其它重组DNA 方法在此处引入作为参考的美国专利号4356270、4399216、4506013、4503142、4952682、 5618676、5854018、5856123、5919651 和 6455275 中描述。也可以使用本领域公知的技术，通过化学合成制备衔接分子及其成分。例如，可以在涉及使用合适的保护基的固相合成方法中使用逐步添加D-氨基酸来合成D-肽。通常用于L-肽的固相肽合成技术在其全部在此处引入作为参考的MeinhofenHormonal Proteins and Peptides, vol. 2, (New York 1983) ；Kent φ, Ann. Rev. Biochem. , 57 :957 (1988)； Bodanszky 等，Peptide Synthesis, (2d ed. 1976) ；Atherton 等，(1989) Oxford, England IRL Press. ISBN 0199630674 ;Stewart 等，(1984)第二版，Rockford =Pierce Chemical Company,91. ISBN 0935940030 和 Merrifield (1963)J. Am. Chem. Soc. 85 :2149-2154 中描述。用于固相合成D-肽的D-氨基酸可以从多种商业来源获得。D-肽和包含混合的L-和 D-氨基酸的肽是本领域中已知的。同样，已经合成了专门包含D-氨基酸的肽(D-肽)。 参见 Zawadzke 等，J. Am. Chem. Soc. , 114 :4002-4003 (1992) ；Milton 等，Science 256 1445-1448(1992)。本领域已经描述了制备D-肽的其它方法，并且可以至少在此处引入作为参考的WIPO公开号W0/1997/013522和美国申请号60/005，508中找到。可以通过蛋白质化学领域中一般已知的蛋白质分离/纯化方法纯化本发明的肽。 非限制性实例包括萃取、重结晶、盐析(例如，用硫酸铵或硫酸钠)、离心、透析、超滤、吸附色谱、离子交换层析、疏水层析、正相色谱、反相色谱、凝胶过滤、凝胶渗透色谱、亲和层析、 电泳、逆流分布或其任何组合。纯化后，可以通过本领域已知的多种方法中任一种将所述肽交换到不同的缓冲液中和/或浓缩，所述方法包括但不限于过滤和透析。纯化的多肽是优选至少85 %或90 %纯的，更优选至少93 %或95 %纯的，以及最优选至少97 %、98 %，或 99%纯的。不管纯度的确切数值，肽足够纯以用作药用产品。实施例本公开进一步通过附图和下述实施例(其不应解释为进一步限制)进行说明。本申请中引用的所有附图和所有参考文献、专利和公开专利申请的内容在此全部通过引用引入。实施例1.选择高亲和力抗-VEGF肽作为靶向部分以及与α Gal配体部分结合使用附图2中描述的mRNA展示方法，对随机化肽序列的文库进行与VEGF的高亲和力结合的筛选。选择了四个高亲和力抗-VEGF肽序列(SEQ ID NO 1_4)。各肽在C-末端以PEG2-NH2或PEG2-Cys-NH2部分PEG化(参见附图4)以促进与Gal抗原(Bdi- (CH2) -NH2, 二糖)的化学偶联。为促进各肽与Gal 二糖的化学结合，采用了具有马来酰亚胺和硫代-NHS官能性的双功能接头(硫代-SMCC，PIERCE)。所述接头与二糖中存在的氨基和肽的C-末端半胱氨酸残基的硫羟基(sulf hydroxy)中的马来酰亚胺官能性反应。为了获得期望的化合物和避免任何进一步的反应和副产物的形成，将反应物在温育后立即进行RP-HPLC纯化。对反应物的量的比率进行优化以避免副产物的形成。在示例性合成中，将6mg 二糖化合物
(CH2)-NH2 ( 15ymol)溶解于 100μ 1 含 20% MeCN 的 0. IM Hepes 缓冲液中，pH 6. 0 ； 将1. 3mg硫代-SMCC接头( 3 μ mol)溶解于100 μ 1含20% MeCN的0. IM Hepes缓冲液中，pH 6. 0 ；并将两种溶液混合和在反应管连续转动条件下在室温下温育30分钟。将Img 肽 07-090 (07-090 ；冻干粉，TFA 加合物，Μ. W. 3474g/mol ； 320nmol)溶解于 Iml H20/MeCN 80 20%中。制备后澄清肽溶液立即加入到接头-二糖溶液中，并在室温下在反应管连续转动条件下额外温育90分钟。将反应混合物置于冰上并将等分试样在RP-HPLC-C18柱上分析。通过在在 0 50%;缓冲液 A :H20/5% MeCN, 0. 1% TFA，缓冲液 B :H20/5% MeCN, 0. 1% TFA的HPLC梯度下运行对期望的化合物(Bdi-(CH2)-NH-接头-S-07-090-肽)进行纯化。 HPLC级分在用65%甲醇、0. 5%甲酸稀释后通过ESI-TOF-MS进行分析，并对产物级分进行鉴定。相关的产物峰级分在_80°C冷冻，并随后冻干至完全干燥以包含期望的化合物。实施例2.抗-VEGF-特异衔接分子可以重定位天然抗-α Gal抗体至VEGF设计了分析方法以测试afeil-连接的抗-VEGF肽重定向特异于a foil的天然抗体以结合VEGF的能力。该分析方法用固相上的重组VEGF设计。然后将系列稀释的
16α Gal-连接的抗-VEGF肽与rVEGF —起温育，接着与含高水平抗α Gal的来自小鼠的血清一起温育。然后用酶联抗小鼠抗体指示结合的抗α foil的量。通过加入显色底物指示酶的存在以及通过测定490nm处的光密度测量颜色的增加。图8中显示的数据清楚表明，由于肽量或抗血清量的降低导致光密度的降低，α (^al-连接的抗-VEGF肽可以重定向天然抗-a Gal抗体至VEGF。
权利要求
1.用于鉴定能够重定向抗体特异性的高亲和力衔接分子的方法，所述方法包括(a)提供编码候选靶向肽群体的随机化文库；(b)从展示文库中选择以高亲和力和/或选择性与目标分子结合的靶向肽；(c)通过连接部分连接靶向肽和配体部分以形成候选衔接分子；和(d)评价所述候选衔接分子重定向循环抗体的特异性到所述目标分子的能力； 从而鉴定该衔接分子。
2.权利要求1所述的方法，其中，连续地进行步骤(a)-(d)。
3.权利要求1或2所述的方法，其中，在步骤(b)之前进行连接步骤(c)。
4.上述权利要求任一项所述的方法，其中，所述文库为mRNA展示、核糖体展示、酵母展示、噬菌体展示或合成肽文库。
5.上述权利要求任一项所述的方法，其中，所述靶向肽以InM或更低的结合亲和力结合目标分子。
6.上述权利要求任一项所述的方法，其中，所述配体部分包括聚糖部分。
7.上述权利要求任一项所述的方法，其中，所述配体部分为血型抗原。
8.上述权利要求任一项所述的方法，其中，所述配体部分为gal抗原或其表位。
9.权利要求8所述的方法，其中，所述配体部分由一个或多个gal-a-l-3-gal 二糖单元组成。
10.权利要求8所述的方法，其中，所述配体部分为具有降低干扰分子的竞争结合的修饰的修饰gal抗原。
11.权利要求8所述的方法，其中，所述配体部分为具有降低酶促降解或化学降解的修饰的修饰gal抗原。
12.权利要求10或11所述的方法，其中，所述修饰gal抗原在末端半乳糖残基的C6’位包含保护基团。
13.上述权利要求任一项所述的方法，其中，所述配体部分为gal抗原的肽模拟物。
14.上述权利要求任一项所述的方法，其中，所述配体部分为肽配体部分。
15.权利要求14所述的方法，其中，所述肽配体部分包含被循环抗体的抗原结合位点选择性结合的表位。
16.权利要求15所述的方法，其中，所述肽配体部分包含抗体的独特位，其中所述独特位选择性地被循环抗独特型抗体结合。
17.权利要求16所述的方法，其中，所述肽配体部分包含Fc结合蛋白的结合位点部分。
18.上述权利要求任一项所述的方法，其中，所述肽配体部分通过(i)提供编码候选肽配体部分群体的随机化mRNA展示文库；和(ii)从步骤(i)的展示文库选择以高亲和力和 /或选择性结合循环抗体的肽配体部分。
19.权利要求18所述的方法，其中，在选择步骤(ii)之前，所述候选肽配体部分与靶向肽融合。
20.权利要求18所述的方法，其中，在选择步骤(ii)之后，所述候选肽配体部分与靶向肽融合。
21.上述权利要求任一项所述的方法，其中，所述目标分子为可溶性疾病相关分子。
22.权利要求21所述的方法，其中，所述重定向的抗体特异性通过测量所述可溶性分子的调理作用或中和作用进行评估。
23.上述权利要求任一项所述的方法，其中，所述配体部分用双功能接头部分与靶向部分连接。
24.权利要求23所述的方法，其中，所述双功能接头部分通过靶向部分的氨基和配体部分的硫醇部分连接靶向部分和配体部分。
25.上述权利要求任一项所述的方法，其中，所述目标分子存在于感染的细胞或肿瘤细胞的表面上。
26.权利要求25所述的方法，其中，所述重定向的特异性通过测量ADCC或CDC-依赖性细胞杀伤进行评估。
27.根据上述权利要求任一项所述的方法鉴定的高亲和力衔接分子，所述衔接分子包含(i)靶向部分，所述靶向部分以高亲和力或选择性结合目标分子，( )配体部分，所述配体部分特异结合循环抗体；和(iii)接头部分，其连接靶向部分和配体部分，其中，所述衔接分子促进抗体和目标分子之间的功能性相互作用。
28.权利要求27所述的高亲和力衔接分子，其中，所述靶向部分为肽靶向部分。
29.权利要求27或观所述的衔接分子，其中，所述靶向部分以高亲和力或选择性结合 VEGF配体。
30.权利要求27- 任一项所述的衔接分子，其中，所述靶向部分包含选自SEQID NO 1、2、3和4的一个或多个序列。
31.权利要求27- 任一项所述的衔接分子，其中，所述靶向部分为PEG化的。
32.权利要求27-30任一项所述的衔接分子，其中，所述配体部分包含特异性结合循环抗Gal抗体的Gal抗原。
33.高亲和力衔接分子，选自下组(a)H-Gly-D-Val-D-Gln-D-Glu-D-Asp-D-Val-D-Ser-D-Ser-D-Thr-D-Leu-Gly-D-Ser -D-Trp-D-Val-D-Leu-D-Leu-D-Pro-D-Phe-D-His-D-Arg-Gly-D-Thr-D-Arg-D-Leu-D-Ser-D-Val-D-Trp-D-Val-D-Thr-PEG2-Cys-X-Y ；(b)H-Gly-Gly-D-Phe-D-Glu-Gly-D-Leu-D-Ser-D-Gln-D-Ala-D-Arg-D-Lys-D-Asp-D -Gln-D-Leu-D-Trp-D-Leu-D-Phe-D-Leu-D-Met-D-Gln-D-His-D-Ile-D-Arg-D-Ser-D-Tyr-D-Arg-D-Thr-D-Ile-D-Thr-PEG2-Cys-X-Y ；(c)H-Gly-D-Val-Gly-Gly-D-Ser-D-Arg-D-Leu-D-Glu-D-Ala-D-Tyr-D-Lys-D-Lys-D -Asp-D-His-D-Arg-D-Val-D-Phe-D-Gln-D-Met-D-Ala-D-Trp-D-Leu-D-Gln-D-Tyr-D-Tyr-D-Trp-D-Ser-D-Thr-D-Thr-PEG2-Cys-X-Y ；和(d)H-Gly-D-Ser-Gly-D-Ser-Gly-D-Asn-D-Ala-D-Leu-D-His-D-Trp-D-Val-D-Cys-D-Ala-D-Ser-D-Asn-D-Ile-D-Cys-D-Trp-D-Arg-D -Thr-D-Pro-D-Trp-D-Ala-Gly-D-Gln-D-Leu-D-Trp-Gly-D-Leu-D-Val-D-Arg-D-Leu-D-Th r-PEG2-Cys-X-Y ；其中，X为具有马来酰亚胺官能团的双功能化学接头；以及Y为氨基修饰的Gal-l-3-Gal 二糖。
全文摘要
本发明披露了用于鉴定高亲和力衔接分子的方法，所述衔接分子结合循环抗体和目标分子并将循环抗体的特异性重定向到目标分子。本发明也提供了示例性的高亲和力衔接分子。
文档编号G01N33/53GK102597771SQ201080045047
公开日2012年7月18日 申请日期2010年10月5日 优先权日2009年10月5日
发明者A·瓦尔内, A·科林逊, G·舒尔曼, M·萨尔伯格, P·瓦格纳, R·卡门 申请人:奥普索尼克治疗公司
专业数控铣床产品供应商
20年生产经验，实力工厂，精工品质，质量有保障
